Зональным типом растительности являются полидоминантные елово-широколиственные леса, в которых содоминантами выступают широколиственные (дуб черешчатый, липа сердцевидная, клен остролистный, ясень обыкновенный, вязы голый и гладкий) и хвойные деревья (преимущественно — ель обыкновенная), а небольшое участие мелколиственных пород (березы повислая и пушистая, осина, ольха серая) связано с естественными локальными нарушениями (групповые вывалы, зоогенные нарушения). Сохранившиеся лесные сообщества природного парка являются вторичными, поскольку они сформировались в результате длительного антропогенного воздействия (рубки, посадки лесных культур, расчистка под сельскохозяйственные угодья, выпас). Отличительными признаками древостоев производных лесов, как правило, являются: преобладание пионерных видов деревьев (преимущественно береза, ольха серая); обедненный породный состав, одновозрастность, упрощенная структура.
В долине р. Сходни сохранились ценные природные биотопы, представляющие собой сложную мозаику суходольных и пойменных лугов, пойменных ольшаников и ивняков, небольших по площади болот. Эти сообщества также сильно преобразованы человеком, однако здесь пока еще сохранились многие редкие и охраняемые виды растений, включенных в Красную книгу г. Москвы.
В ходе работ в рамках ботанических исследований на территории природного парка, проведённых в 2004 — 2007 гг. (группа под рук. Очагова Д.М., в 2007-м дополнено данными Ю.А Насимовича) было зарегистрировано 462 вида сосудистых растений, 8 видов мохообразных, 64 вида мхов. Названия видов приведены по сводке (Черепанов, 1995). На 2007 г. выявлено 38 видов сосудистых растений, включённых в Красную книгу г. Москвы, а также 26 видов сосудистых растений Приложения 1 к Красной книге г. Москвы, 18 видов мохообразных и мхов, занесённых в Красную книгу г. Москвы с приложениями.